大掃除

年末ということで研究室の大掃除。
お茶部屋の本棚を大部屋に移して、少し模様替え。
どうなることかと思ったけど、かなりいい感じで、すっきりしました。

GAMの作図

GAM（一般化加法モデル）の結果をplot()したときの予測値がどう算出されているのか分からず、ずっともやもやしていたけど、何となく解決した。

とりあえず、plot()をして出てくる図のy軸は、
「線形予測子を正規化した値」
であることが判明。

Rで書くと、
scale(result$linear.predictor, scale=F)
あるいは、
result$linear.predictor - mean(result$linear.predictor)
とも書ける。
※resultはgam()の結果


では変数が二つ以上ある場合は、どうなっているのか？
これはどうやら注目しない変数を固定して求めているっぽい。
たとえば、y~x0+x1でx0の図を書くときは、x1の値は0とかに固定した上で予測すると結果が一致する。
（最後に正規化するので、x1はどの値に固定しても関係ない）

実際にやるには、以下のようなイメージ
dat.x0 <- data.frame(x0, x1_0) #x1を0に固定したデータセット
pre.x0 <- predict(result, dat.x0, type="link")
plot(x0, scale(pre.x0, scale=F))

散布図と重ねるにはどうすればよいのだろう？

見えた？

最近ずっと取り組んでいた企画集会用の解析、なんとか目処が立ったかもしれない。
ひとまずこれでまとめて、企画者に意見を聞いてみることにしようかな。

間違い電話

見知らぬ番号から電話が掛ってきたので出てみると、小中高と同じ学校（しかも高校は同じ部活）に通っていた友人だった。
どうやら高校の部活の先輩に電話を掛けたつもりが、間違って自分に掛けてしまったらしい。

実はこの友人、数年前に携帯電話の使用をやめて以来、連絡不能に陥っていた。
（まあ実家に電話すれば、連絡はついただろうけど）
今回の件で連絡先が分かったので、よかったよかった。

今度ゆっくり話をしたいもんだ。

論文&応募

LG論文を先生に送った。
これでD論の中身はすべて手元から離れた（とりあえずだけど）。

そのあと、某公募のための書類を揃えて、郵便局へ。
うまくいきますように・・・。

さあ、これで少しの間だけど泥沼の解析に挑める。
参考になりそうな論文も見つけたし、頑張りますか。

整形

今日もLG論文。
細かいところを直しつつ、投稿規定に合わせる作業。
しかし論文の最後ってのは、いつ見てもこれで良いのか不安になる・・・。
（そもそも最後にいろいろ書くのって苦手）
時間もないので、グラフに信頼区間を書いたら、もう一度見直して、先生に送ってしまおう。

子供が寝た後は、公募書類の自己アピールをば。
もちろんこれも苦手だけど、なんとか下書き完了。
明日もう一度見直そう。

とりあえず一区切り

D論最後の章のLG論文の英語化は、今日で仮終了。
明日からは推敲に移って、来週中には先生に送りたい。

裏でやっているGIS作業もそろそろ終わらせて、解析したい（というか、しなければ・・・）。

よく考えると、他にもやることが山積みだ・・・。

忘年会が待ち遠しいけど、すぐ来たら困るという今日この頃です。

ばたばた

今日の午前中は、何故かてんやわんやで、気づいたらお昼。
結局午後も忙しく、D論は1文字も進まなかった・・・。

しかしそんな中、英文校閲から論文が返ってきた。
さあCPに投稿するぞ！と投稿規定を細かく読んでいると、
「フィールド調査は2シーズン以上おこなっていないと受理しねーよ」
みたいなことが書いてあった。
1シーズンしかやってないんですけど・・・ダメかな？
ま、ダメだったらすぐ返ってくるだろう、ということで明日投稿しよ。

予約完了

生態学会に向けて、飛行機と宿の予約が完了。

ウォーターマークホテル札幌
じゃらんで1泊4000円。
もっと安いところもたくさんあったけど、旅費が出るし良いかな、と。
ビジネスホテルながら、風呂・トイレ・洗面台が独立しているところが気に入りました。

これで準備が整っていないのは、発表内容だけだ！（これが一番重要・・・）

冠水初体験

いやー今朝の雨はひどかった。
そして生まれて初めて、冠水した道路を車で通過するはめに。
テレビでしか見たことなかった光景そのままで、ちょっと緊張しました。
このあたりに住む限り、避けられないんだろうなあ。

今日のD論は、マテメソの途中まで。
明日は結果まで終わらせよう。

停滞

昨日から新しく事務の人が研究室に加入した。
指導教員はメチャメチャ忙しそうだったので（今年は特に）、良かった良かった。

今日は、D論は順調に進んだものの、他は停滞。
特に企画集会用の解析は泥沼の様相を呈してきた・・・。
少し発想の転換が必要かなぁ。